Inhoud
- Grootste verschil
- Vergelijkingstabel
- Wat is Genomic Library?
- Wat is cDNA-bibliotheek?
- Genomische bibliotheek versus cDNA-bibliotheek
Grootste verschil
Genomische bibliotheek en CDNA-bibliotheek worden gebruikt bij genklonering om verschillende DNA's te isoleren. Het belangrijkste verschil tussen deze twee bibliotheken is dat de genomische bibliotheek DNA-fragmenten bevat die het hele genoom van een organisme tot expressie brengen, terwijl in de cDNA-bibliotheek mRNA uit specifieke cellen van een organisme wordt genomen en vervolgens cDNA uit die mRNA wordt gemaakt in een reactie die gekatalyseerd door een enzym.
Vergelijkingstabel
| Genomische bibliotheek | cDNA-bibliotheek | |
| Definitie | Een genomische bibliotheek is een verzameling van het totale genomische DNA van een enkel organisme. Het DNA wordt opgeslagen in een populatie van vergelijkbare vectoren, die elk een andere insert van DNA bevatten. | Een CDNA-bibliotheek is een combinatie van gekloneerde CDNA-fragmenten die zijn ingebracht in een verzameling gastheercellen, die samen een deel van het transcriptoom van het organisme vormen. |
| Uitdrukking | Hele genoom | Alleen specifieke genen. |
| Grootte | grotere | Kleiner |
| intronen | Cadeau | Afwezig |
| Vector | Het maakt gebruik van plasmiden, cosmiden, lambda-fagen, YAC en BAC voor het opnemen van grote fragmenten. | Het heeft geen introns, dus gebruikt het plasmiden, faagmiden, lambda-fagen om kleine fragmenten op te nemen. |
Wat is Genomic Library?
In het genkloneringsproces wordt het gen van interesse gekopieerd uit DNA gescheiden van een organisme. Wanneer DNA van een organisme wordt gescheiden, worden alle genen in één keer geëxtraheerd. DNA van het organisme bevat duizenden verschillende genen. Genetische ingenieur vindt één specifiek gen dat codeert voor het specifieke eiwit van interesse. Er is geen enkele techniek waarmee een specifiek gen uit DNA kan worden gevonden, dus wetenschappers maken genenbibliotheken om het DNA van het organisme te catalogiseren. Wetenschappers, selecteer vervolgens het gewenste gen uit de bibliotheek. Genenbibliotheek is een verzameling levende bacteriekolonies die zijn getransformeerd met verschillende stukjes DNA van het organisme dat de bron is van het gewenste gen. DNA wordt geëxtraheerd uit organisme om een bibliotheek te construeren die een georganiseerde vorm van DNA is. Genomische bibliotheek en cDNA zijn twee soorten genbibliotheken. Verschillende technieken van genklonering zijn gebruikt als genstrategieën in recombinante technologie. DNA-fragmenten worden gescheiden door knippen met specifieke restrictie-enzymen van ouder-DNA. Deze fragmenten worden geligeerd in vectormoleculen en de verzamelde moleculen worden overgebracht naar gastheercellen, één molecuul in elke cel. De genomische bibliotheek bestaat uit introns, junk-DNA en vele andere fragmenten. In deze bibliotheek wordt DNA opgedeeld in kleinere fragmenten in een cel. Hierna worden alle kleine delen in een vector ingevoegd om een bibliotheek te maken. De genomische bibliotheek bevat al het DNA van de hele cel en genen bevatten al hun introns. Genomisch DNA is de vertaling van het hele genoom. Het codeert niet het hele deel op één codon vanwege de grootte van introns. Er is geen splicingmechanisme in een genomische bibliotheek die problemen veroorzaakt bij de expressie van genen die uit deze bibliotheek zijn genomen.
Wat is cDNA-bibliotheek?
cDNA-bibliotheek wordt geconstrueerd door één cel- of weefseltype te selecteren. Dan wordt mRNA geïsoleerd uit die cel of dat weefsel. Een DNA-kopie van het mRNA-molecuul wordt gemaakt met behulp van specifiek enzym reverse transcriptase-enzym. Dus cDNA-bibliotheek bevat dat specifieke DNA dat aanwezig is in mRNA. Geen introns en geen DNA-sequentie zijn aanwezig in deze bibliotheek. In deze bibliotheek zijn alle klonen van volledige lengte. Bovendien is een cDNA-kloon nodig om cellen te doorsnijden voor eiwitproductie of voor op cellen gebaseerde assays.
Genomische bibliotheek versus cDNA-bibliotheek
- De genomische bibliotheek is rechtstreeks samengesteld uit het genomische DNA.
- cDNA-bibliotheek is gevormd met behulp van mRNA als sjabloon.
- Genomische bibliotheek brengt het gehele genoom van het organisme tot expressie.
- cDNA-bibliotheek vertegenwoordigt alleen genen van specifieke aandoeningen.
- Twee enzymen, restrictie-endonucleasen en ligasen zijn significant voor genomische bibliotheekconstructie.
- Reverse transcriptase-enzym speelt een belangrijke rol bij de constructie van cDNA-bibliotheken.
- Genomische bibliotheek brengt het DNA van zowel prokaryotische als eukaryotische organismen tot expressie.
- cDNA-bibliotheek vertegenwoordigt het DNA van alleen eukaryote organismen.
- Een genomische bibliotheek is niet in staat tot expressie in het prokaryotische organisme omdat ze introns bezitten en het prokaryotische organisme geen machines heeft om introns te verwerken.
- cDNA-bibliotheek is in staat tot genoomexpressie in bacteriën die prokaryotisch is omdat ze introns missen.
